Στο χώρο αυτό είναι εγκαταστημένα μικροσκόπια και στερεοσκόπια τα οποία είναι εφοδιασμένα με προγράμματα επεξεργασίας εικόνας όπου ερευνάται η βοτανική και γεωγραφική προέλευση του μελιού  και η μορφολογία και φυσιολογία των μελιτογόνων εντόμων του πεύκου και της ελάτης. Το Εργαστήριο διαθέτει συλλογές γυρεοκόκκων από μελισσοκομικά φυτά διαφόρων περιοχών της χώρας καθώς επίσης και συλλογή αποξηραμένων μελισσοκομικών φυτών.